linka 3805 (tel. 220 443 805)
-
Vzdělání a kvalifikace
- 2017
- Jmenován profesorem biochemie, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, VŠCHT Praha.
- 2007
- Habilitace v oboru biochemie, Fakulta potravinářské a biochemické technologie, VŠCHT Praha.
- 1989
- CSc. v oboru organická chemie, Fakulta chemické technologie VŠCHT Praha
- 1988
- Postgraduální kurs "NMR spektroskopie v kapalné a pevné fázi", Fakulta chemickej technológie, Slovenská vysoká škola technická v Bratislavě
- 1982
- Ing. v oboru organická chemie, Fakulta chemické technologie, VŠCHT Praha
- Zaměstnání
- 2003–
- vedoucí Centrálních laboratoří VŠCHT Praha
- 1996–
- vedoucí Laboratoře NMR spektroskopie na VŠCHT Praha
- 1993–1996
- Research Associate na Biotechnology Research Institute, div. Biomolecular Interactions. National Research Council of Canada, Montreal, Canada
- 1992–1993
- vedoucí laboratoře NMR, VŠCHT Praha
- 1990
- krátkodobý studijní pobyt na Inorganic Chemistry Department of the Oxford University, Prof. R.J.P. Williams (Study of binding zinc ion to short peptides)
- 1987–1992
- odborný pracovník v NMR laboratoři
- 1986–1987
- vědecký pracovník na Katedře organické chemie VŠCHT Praha
Oblasti výzkumu
Aplikace NMR spektroskopie s vysokým rozlišením v chemii, biochemii a molekulární biologii. Molekulové modelování, především pro zkoumání struktury peptidů, proteinů a jejich komplexů.
Vybrané publikace
Šebek P., Nešpůrek S., Hrabal R., Adamec M., Kuthan J.: Novel Preparation Photochromic Properties of 2,4,4,6-tetraaryl-4H-thiopyrans. J.Chem. Soc.-Perkin Trans 2 1301-1308 (1992) [IF 1.863, cited 34]
Srinivasan J., Hu S., Hrabal R., Zhu Y., Komives E.A., Ni F.: Thrombin-Bound Structure of an EGF Subdomain from Human Thrombomodulin Determined by Tranferred Nuclear Overhauser Effect. Biochemistry 33, 13553 (1994) [IF 3.922, cited 28]
Hrabal R., Komives. E.A., Ni F.: Structure Resiliency of an EGF-like Subdomain Bound to its Target Protein, Thrombin. Protein Science, 5, 195 (1996) [IF 3.787, cited 20]
Lang J., Dvořáková H., Bartošová I., Lhoták P., Stibor I., Hrabal R.: Conformational flexibility of a novel tetraethylether of thiacalix[4]arene. A comparison with the "classical" methylene-bridged compounds. Tetrahedron Lett. 40, 373-376 (1999) (IF 2.615, cited 41]
Veverka V., Bauerová H., Zábranský A., Lang J., Ruml T., Pichová I., Hrabal R.: Three-dimensional Structure of a Monomeric Form of a Retroviral Protease. J. Mol.Biol. 333, 771-780 (2003) [IF 4.472, cited 5]
Hrabal R., Chen Z., James S., Bennet H.P.J., Ni F.: The hairpin stack fold, a novel protein architecture for a new family of protein growth factors. Nature Structural Biology, 3, 747-652 (1996) [IF 11.085, cited 35]
Zábranská H., Tůma R., Kuhl I., Svatoš A., Ruml T., Hrabal R., Pichová I.: The role of the S-S bridge in retroviral protease fiction And virion maturation. J. Mol. Biol. 365, 1493-1502 (2007) [IF 4.472, cited 2]
Vlach J., Lipov J., Rumlová M., Veverka V., Lang J., Srb P., Knejzlík Z., Pichová I., Hunter E., Hrabal R., Ruml T.: D-retrovirus morhogenetic switch driven by the targeting signal accessibility to Tctex-1 of dynein. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105, 10565-10570 (2008) [IF 9.598, cited 1]
Vlach J., Srb P., Prchal J., Grocký M., Lang J., Ruml T., Hrabal R. (2009) Nonmyristoylated Matrix Protein from the Mason-Pfizer Monkey Virus Forms Oligomers. J. Mol. Biol., 390(5), 967–980. doi:10.1016/j.jmb.2009.05.063
Srb P., Vlach J., Prchal J., Grocký M., Ruml T., Lang J., Hrabal R. (2011) Oligomerization of a retroviral matrix protein is facilitated by backbone flexibility on nanosecond time scale. J. Phys. Chem. B, 115(11), 2634-2644.doi: 10.1021/jp110420m
Prchal, J., Srb, P., Hunter, E., Ruml, T., Hrabal, R. (2012)The Structure of Myristoylated Mason-Pfizer Monkey Virus Matrix Protein and the Role of Phosphatidylinositol-(4,5)-bisphosphate in its Membrane Binding.J.Mol.Biol., 423(3), 427-438. doi:10.1016/j.jmb.2012.07.021
Junkova, P., Vermachova, M., Prchal, J., Kuckova, S., Hrabal, R., Hynek, R. (2013) Improved Approach for the Labeling of Argininne, Glutamic, and Aspartic Acid Side Chains in Proteins Using Chromatographic Techniques. J. Liq. Chromatogr. Relat. Technol., 36(9), 1221-1230. doi:10.1080/10826076.2012.685918
Rozbeský, D., Krejzová, J., Křenek, K., Prchal, J., Hrabal, R., Kožíšek, M., Weignerová, L., Fiore, M., Dumy, P., Křen, V., Renaudet, O. (2014) Re-Evaluation of Binding Properties of Recombinant Lymphocyte Receptors NKR-P1A and CD69 to Chemically Synthesized Glycans and Peptides. Int. J. Mol. Sci., 15(1), 1271-1283. doi:10.3390/ijms15011271
Prchal, J., Kroupa, T., Ruml, T., Hrabal, R. (2014) Interaction of Mason-Pfizer monkey virus matrix protein with plasma membrane. Front. Microbiol. 4(423), doi: 10.3389/fmicb.2013.00423
Kroupa, T., Prchal, J., Doležal, M., Ruml, T., & Hrabal, R. (2014). Cost-effective method for the preparation of uniformly labeled myristoylated proteins for NMR measurements. Protein Expr. Purif., 99, 6-9. doi:10.1016/j.pep.2014.03.005
Junková, P., Prchal, J., Spiwok, V., Pleskot, R., Kadlec, J., Krásný, L., Hynek, R., Hrabal, R. and Ruml, T. (2016), Molecular aspects of the interaction between Mason—Pfizer monkey virus matrix protein and artificial phospholipid membrane. Proteins, 84: 1717–1727. doi:10.1002/prot.25156
Kroupa T., Langerová H., Doležal M., Prchal J., Spiwok V., Hunter E., Rumlová M., Ruml T., Hrabal R. (2016), Membrane Interactions of the Mason-Pfizer Monkey Virus Matrix Protein and Its Budding Deficient Mutants. J.Mol.Biol. 428(23):4708-4722. doi: 10.1016/j.jmb.2016.10.010.